稻属最全超等泛基因组图谱问世
原标题:稻属最全超等泛基因组图谱问世日前,国外学术期刊《当然·通信》在线刊发江西省农业科学院原院长颜龙安院士团队都集河北大学杜会龙训诲团队的推敲效果:首个稻属最全超等泛基因组图谱画图告捷。
泛基因组是一个物种中统统个体基因组信息的总额,构建泛基因组不错灵验不停单一参考基因组带来的遗传信息分析偏差。超等泛基因组代表一个属内统统物种的基因组信息,尤其蕴含了野生种中丰富的基因组变异,是对泛基因组的进一步延伸,在远缘杂交和基因发掘等标的具有进击应用出路。稻属隶属于禾本科的稻亚科,包括2个训诲稻种和21个野生稻种。其中,野生稻为训诲稻近缘物种,是当代水稻品种遗传改造和种质改变的基因宝库,具有进击的挖掘价值。
推敲团队拼装了稻属13个近乎好意思满的野生稻种的基因组,并联接已公开的豪迈野生稻、亚洲训诲稻和非洲训诲稻基因组,构建了包含101723个基因眷属的稻属超等泛基因组。其中,稻属共有的中枢基因眷属仅占9.84%,共轻薄到63881个训诲稻中尚未发现的新基因眷属,使可应用的水稻基因扩大了1.7倍。同期,基于高质地的基因组图谱,初度在基因组水平重构了稻属的进化磋磨。
该推敲构建的稻属超等泛基因组极地面延伸了水稻遗传改造的基因池,对野生稻种质改变利工具有进击表面道理道理和应用价值,同期为稻属进化和驯化推敲提供新的见解。(记者王洋、李玉兰、胡晓军)